Dusun Kliwonan memiliki sejarah yang unik dan erat kaitannya dengan tradisi mengaji. Awalnya, kegiatan mengaji diinisiasi oleh seorang tokoh dari daerah  Kembang Kidul. Hal ini terjadi karena masjid tertua, peninggalan Haji Abdullah, berada di Desa Jati dengan pusat kegiatan di Kembang Kidul. Seiring berjalannya waktu, kegiatan mondok di Kembang Kidul semakin berkurang dan akhirnya tidak ada lagi santri yang mondok di sana. Oleh karena itu, kegiatan mondok pun berpindah ke Dusun Kliwonan, di mana masih ada santri yang  mondok dan belajar di bawah ...